針對集水區進(jìn)行有效管理有許多優(yōu)點(diǎn)。通過(guò)減少水源污染，從而減少了需要處理的環(huán)節，也會(huì )減少水處理產(chǎn)生的副產(chǎn)物并降低運行成本。 

１）有害物的識別
      了解原水水質(zhì)變化的原因非常重要，因為它將影響對水處理工藝的要求、處理效率以及最終產(chǎn)出飲用水的健康危害性。通常，原水水質(zhì)受天然因素和人為因素兩方面的影響。重要的天然因素包括野生動(dòng)植物、氣候、地形、地質(zhì)和植被等情況。人為因素包括點(diǎn)源（如廢水排放）和非點(diǎn)源（如地表徑流）。例如，市政廢水排放是病原體的重要來(lái)源；城市徑流和家畜養殖可以帶來(lái)大量的微生物污染；人類(lèi)休閑娛樂(lè )活動(dòng)可以是糞便污染的來(lái)源；以及含有農用化學(xué)品和肥料的農業(yè)徑流，這些都可以增加水處理工作的難度。
      不論是從地表還是從地下取水，重要的是要了解當地集水區或地下含水層的特征，并要識別引起水污染的根源并加以管理。集水區可能造成污染的活動(dòng)能減少到什么程度，會(huì )受到水源競爭以及集水區開(kāi)發(fā)壓力的制約。然而，在土地利用和有害物控制上采用合適的操作往往是可行的，而不必嚴格限制一些活動(dòng)。在各利害相關(guān)者之間開(kāi)展合作可能是一種很有力的措施，既可以減少污染又不會(huì )減少發(fā)展的效益。
       水資源和水源保護是保護飲用水水質(zhì)的第一道防線(xiàn)。當集水區管理工作超出了飲用水供水單位的管轄權限范圍時(shí)，控制措施的規劃與實(shí)施就需要與其他機構進(jìn)行合作。這里包括計劃主管部門(mén)、集水區、環(huán)境和水資源、道路管理部門(mén)，處理突發(fā)事件機構以及農業(yè)、工業(yè)和其他商業(yè)部門(mén)，他們的活動(dòng)都可能影響水質(zhì)。也許在開(kāi)始不大可能開(kāi)展水資源和水源保護的所有方面，但應優(yōu)先開(kāi)展集水區的管理工作。這樣，能使多個(gè)利益相關(guān)機構對飲水資源共同負責，評估污染風(fēng)險，并制訂改進(jìn)管理工作計劃以減少這些風(fēng)險。
      從地下深部承壓含水層抽取的地下水，通常在沒(méi)有直接污染的情況下，其微生物方面是安全的，且化學(xué)成分也比較穩定。然而，淺層的非承壓含水層可能受到農業(yè)活動(dòng)排放或滲漏產(chǎn)生的污染（如病原體、硝酸鹽和農藥），以及受到當地衛生設施和污水處理（病原體和硝酸鹽）和工業(yè)廢物的污染。

        ２）控制措施

        有效的資源和水源保護包括以下要素：
        ● 制訂和執行集水區管理計劃，包括保護地表水和地下水水源的控制措施；

        ● 保證在制訂規章時(shí)內容包括對水資源的保護（土地利用計劃和流域管理），避免潛在的污染活動(dòng)，并加以強制執行；

        ● 提高社區成員的認識，意識到人的活動(dòng)對水質(zhì)的影響。
       當有多個(gè)水源可以利用時(shí)，可以靈活地選擇用哪個(gè)水源來(lái)處理和供水。這樣就可以避免從質(zhì)量不好的河流中取水（如大雨之后），以減少風(fēng)險并防止在后續處理過(guò)程中可能出現的問(wèn)題。在水庫中存放的水，由于沉降和滅活作用，包括陽(yáng)光（紫外線(xiàn)）消毒，可以減少糞便微生物的數量，但也增加了污染物進(jìn)入水體的機會(huì )。大多數來(lái)源于糞便的病原微生物（腸道病原體）在環(huán)境中不能無(wú)限期的存活。實(shí)際上腸道細菌經(jīng)過(guò)幾周時(shí)間將相繼死去。腸道病毒和原蟲(chóng)存活時(shí)間較長(cháng)（數周到數月），但常因沉降作用和與土著(zhù)微生物的對抗而被去除。水的滯留也使懸浮物沉降，使后續的消毒作用更有效并減少消毒副產(chǎn)物（ＤＢＰ）的形成。 地下水水源的控制措施應包括保護含水層和鉆孔周?chē)庠馕廴?，并保證鉆孔的完整（地表面加封，套管完整無(wú)損等）。